Sakoku — chính sách tỏa quốc của Nhật Bản

Trong những năm 1633–1639, Mạc phủ Tokugawa ban hành một loạt lệnh mà về sau gọi chung là sakoku (鎖国, "khóa nước"). Lệnh năm 1635 cấm thuyền Nhật đi ra nước ngoài và quy định người Nhật đang ở hải ngoại nếu trở về sẽ bị xử tử. Năm 1639, người Bồ Đào Nha bị trục xuất hoàn toàn. Từ năm 1641, người Hà Lan chỉ được buôn bán trên đảo nhân tạo Dejima ở Nagasaki; thuyền Trung Hoa cũng chỉ được cập Nagasaki.

Lý do chính: Mạc phủ lo ngại ảnh hưởng của đạo Kitô và sức mạnh của các lãnh chúa giàu lên nhờ ngoại thương. Hệ quả là hệ thống thuyền Châu ấn chấm dứt; các "phố Nhật" (Nihonmachi) ở Hội An, Ayutthaya, Manila… dần tàn lụi vì không còn người sang, còn người ở lại thì không được về.

Ở Hội An vẫn còn vài ngôi mộ người Nhật thế kỷ XVII. Nổi tiếng nhất là mộ Tani Yajirobei (mất năm 1647): tương truyền ông bị buộc về nước vì lệnh tỏa quốc, rồi liều trốn trở lại Hội An để tìm người yêu và mất tại đây — chuyện này là truyền thuyết địa phương, chưa có sử liệu xác nhận.

Nhật Bản chỉ mở cửa trở lại sau khi hạm đội Mỹ của Perry đến năm 1853–1854.